Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms