Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms