Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTF4P34130 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTF4P34130 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTF4P34130 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTF4P34130 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NTF4P34130 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTF4P34130 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTF4P34130 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTF4P34130 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTF4P34130 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTF4P34130 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTF4P34130 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTF4P34130 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTF4P34130 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTF4P34130 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTF4P34130 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTF4P34130 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTF4P34130 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF4P34130 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF4P34130 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF4P34130 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF4P34130 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF4P34130 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF4P34130 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF4P34130 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF4P34130 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF4P34130 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF4P34130 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF4P34130 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF4P34130 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF4P34130 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF4P34130 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF4P34130 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF4P34130 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF4P34130 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF4P34130 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF4P34130 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF4P34130 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF4P34130 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF4P34130 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF4P34130 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF4P34130 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF4P34130 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF4P34130 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF4P34130 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF4P34130 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF4P34130 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF4P34130 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF4P34130 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF4P34130 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF4P34130 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF4P34130 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF4P34130 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF4P34130 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF4P34130 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF4P34130 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF4P34130 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF4P34130 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF4P34130 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF4P34130 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF4P34130 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF4P34130 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF4P34130 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF4P34130 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF4P34130 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF4P34130 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF4P34130 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF4P34130 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF4P34130 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF4P34130 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF4P34130 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF4P34130 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF4P34130 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF4P34130 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF4P34130 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF4P34130 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF4P34130 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF4P34130 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF4P34130 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF4P34130 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF4P34130 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF4P34130 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF4P34130 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF4P34130 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF4P34130 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF4P34130 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF4P34130 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF4P34130 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF4P34130 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF4P34130 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF4P34130 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF4P34130 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF4P34130 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF4P34130 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF4P34130 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF4P34130 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF4P34130 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF4P34130 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF4P34130 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF4P34130 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms