Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCKARP32238 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCKARP32238 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCKARP32238 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCKARP32238 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCKARP32238 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCKARP32238 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCKARP32238 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCKARP32238 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCKARP32238 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CCKARP32238 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCKARP32238 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCKARP32238 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCKARP32238 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCKARP32238 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCKARP32238 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCKARP32238 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCKARP32238 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCKARP32238 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCKARP32238 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCKARP32238 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CCKARP32238 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CCKARP32238 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCKARP32238 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCKARP32238 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCKARP32238 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CCKARP32238 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCKARP32238 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCKARP32238 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCKARP32238 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCKARP32238 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCKARP32238 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCKARP32238 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCKARP32238 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCKARP32238 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCKARP32238 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCKARP32238 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCKARP32238 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCKARP32238 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCKARP32238 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCKARP32238 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCKARP32238 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCKARP32238 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCKARP32238 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCKARP32238 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCKARP32238 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCKARP32238 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCKARP32238 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCKARP32238 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCKARP32238 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCKARP32238 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCKARP32238 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCKARP32238 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCKARP32238 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCKARP32238 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCKARP32238 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCKARP32238 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCKARP32238 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCKARP32238 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCKARP32238 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCKARP32238 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCKARP32238 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCKARP32238 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCKARP32238 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCKARP32238 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCKARP32238 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCKARP32238 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCKARP32238 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCKARP32238 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCKARP32238 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCKARP32238 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCKARP32238 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCKARP32238 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCKARP32238 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCKARP32238 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCKARP32238 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCKARP32238 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCKARP32238 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCKARP32238 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCKARP32238 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCKARP32238 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCKARP32238 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCKARP32238 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCKARP32238 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCKARP32238 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CCKARP32238 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCKARP32238 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCKARP32238 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CCKARP32238 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCKARP32238 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCKARP32238 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CCKARP32238 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CCKARP32238 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CCKARP32238 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCKARP32238 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCKARP32238 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCKARP32238 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCKARP32238 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCKARP32238 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCKARP32238 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms