Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXA7P31268 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXA7P31268 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXA7P31268 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXA7P31268 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms