Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms