Protein–RNA interactions for Protein: P28907

CD38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD38P28907 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD38P28907 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD38P28907 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD38P28907 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD38P28907 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD38P28907 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD38P28907 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD38P28907 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD38P28907 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD38P28907 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD38P28907 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD38P28907 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD38P28907 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD38P28907 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD38P28907 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD38P28907 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD38P28907 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CD38P28907 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CD38P28907 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD38P28907 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD38P28907 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD38P28907 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD38P28907 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD38P28907 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD38P28907 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD38P28907 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD38P28907 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD38P28907 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD38P28907 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD38P28907 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD38P28907 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD38P28907 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CD38P28907 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD38P28907 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD38P28907 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD38P28907 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD38P28907 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD38P28907 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD38P28907 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD38P28907 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD38P28907 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD38P28907 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD38P28907 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD38P28907 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD38P28907 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD38P28907 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD38P28907 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD38P28907 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD38P28907 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CD38P28907 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD38P28907 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD38P28907 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD38P28907 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD38P28907 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD38P28907 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CD38P28907 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD38P28907 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD38P28907 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD38P28907 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD38P28907 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD38P28907 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD38P28907 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD38P28907 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD38P28907 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD38P28907 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD38P28907 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD38P28907 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD38P28907 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD38P28907 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD38P28907 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD38P28907 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD38P28907 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD38P28907 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD38P28907 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CD38P28907 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD38P28907 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD38P28907 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD38P28907 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD38P28907 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CD38P28907 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CD38P28907 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD38P28907 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD38P28907 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD38P28907 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD38P28907 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD38P28907 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD38P28907 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD38P28907 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CD38P28907 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD38P28907 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD38P28907 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD38P28907 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD38P28907 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD38P28907 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD38P28907 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD38P28907 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD38P28907 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD38P28907 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CD38P28907 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CD38P28907 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms