Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PLNP26678 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PLNP26678 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PLNP26678 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PLNP26678 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PLNP26678 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PLNP26678 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PLNP26678 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PLNP26678 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PLNP26678 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PLNP26678 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PLNP26678 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PLNP26678 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PLNP26678 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PLNP26678 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PLNP26678 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PLNP26678 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PLNP26678 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PLNP26678 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PLNP26678 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PLNP26678 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PLNP26678 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PLNP26678 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PLNP26678 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PLNP26678 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PLNP26678 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PLNP26678 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PLNP26678 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PLNP26678 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PLNP26678 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PLNP26678 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PLNP26678 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PLNP26678 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PLNP26678 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PLNP26678 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PLNP26678 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PLNP26678 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PLNP26678 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PLNP26678 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PLNP26678 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PLNP26678 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PLNP26678 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms