Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms