Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms