Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HRCP23327 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HRCP23327 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HRCP23327 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HRCP23327 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HRCP23327 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HRCP23327 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HRCP23327 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HRCP23327 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HRCP23327 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HRCP23327 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HRCP23327 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HRCP23327 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
HRCP23327 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HRCP23327 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HRCP23327 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HRCP23327 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HRCP23327 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HRCP23327 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HRCP23327 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HRCP23327 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HRCP23327 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HRCP23327 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
HRCP23327 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
HRCP23327 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HRCP23327 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HRCP23327 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HRCP23327 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HRCP23327 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HRCP23327 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HRCP23327 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HRCP23327 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HRCP23327 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HRCP23327 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HRCP23327 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HRCP23327 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HRCP23327 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HRCP23327 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HRCP23327 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HRCP23327 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HRCP23327 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HRCP23327 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
HRCP23327 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HRCP23327 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HRCP23327 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HRCP23327 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HRCP23327 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HRCP23327 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
HRCP23327 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HRCP23327 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HRCP23327 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HRCP23327 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HRCP23327 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HRCP23327 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HRCP23327 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HRCP23327 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HRCP23327 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HRCP23327 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HRCP23327 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HRCP23327 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HRCP23327 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HRCP23327 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HRCP23327 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HRCP23327 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HRCP23327 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HRCP23327 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HRCP23327 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HRCP23327 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HRCP23327 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HRCP23327 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HRCP23327 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HRCP23327 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HRCP23327 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HRCP23327 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HRCP23327 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HRCP23327 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HRCP23327 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HRCP23327 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HRCP23327 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HRCP23327 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HRCP23327 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HRCP23327 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HRCP23327 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HRCP23327 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HRCP23327 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HRCP23327 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HRCP23327 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HRCP23327 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HRCP23327 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HRCP23327 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HRCP23327 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HRCP23327 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HRCP23327 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HRCP23327 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HRCP23327 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HRCP23327 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HRCP23327 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HRCP23327 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
HRCP23327 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HRCP23327 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms