Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF1P22415 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF1P22415 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
USF1P22415 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
USF1P22415 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF1P22415 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF1P22415 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF1P22415 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF1P22415 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF1P22415 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF1P22415 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
USF1P22415 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
USF1P22415 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF1P22415 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF1P22415 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF1P22415 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF1P22415 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF1P22415 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF1P22415 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
USF1P22415 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF1P22415 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF1P22415 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF1P22415 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
USF1P22415 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF1P22415 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF1P22415 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF1P22415 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF1P22415 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF1P22415 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF1P22415 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF1P22415 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF1P22415 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF1P22415 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF1P22415 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF1P22415 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF1P22415 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF1P22415 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF1P22415 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF1P22415 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF1P22415 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF1P22415 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF1P22415 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF1P22415 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF1P22415 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF1P22415 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF1P22415 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF1P22415 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF1P22415 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
USF1P22415 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF1P22415 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
USF1P22415 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
USF1P22415 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF1P22415 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF1P22415 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF1P22415 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF1P22415 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF1P22415 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
USF1P22415 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF1P22415 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF1P22415 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF1P22415 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
USF1P22415 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF1P22415 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF1P22415 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF1P22415 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF1P22415 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF1P22415 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF1P22415 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF1P22415 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF1P22415 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF1P22415 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF1P22415 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF1P22415 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF1P22415 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF1P22415 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
USF1P22415 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
USF1P22415 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
USF1P22415 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
USF1P22415 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
USF1P22415 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
USF1P22415 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
USF1P22415 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
USF1P22415 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
USF1P22415 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
USF1P22415 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
USF1P22415 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
USF1P22415 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
USF1P22415 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USF1P22415 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USF1P22415 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USF1P22415 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USF1P22415 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USF1P22415 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USF1P22415 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USF1P22415 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USF1P22415 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USF1P22415 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USF1P22415 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USF1P22415 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USF1P22415 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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