Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms