Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATF3P18847 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATF3P18847 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATF3P18847 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATF3P18847 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATF3P18847 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF3P18847 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF3P18847 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF3P18847 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF3P18847 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF3P18847 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF3P18847 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF3P18847 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF3P18847 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF3P18847 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF3P18847 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF3P18847 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF3P18847 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF3P18847 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF3P18847 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF3P18847 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF3P18847 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF3P18847 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF3P18847 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF3P18847 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF3P18847 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF3P18847 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATF3P18847 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATF3P18847 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATF3P18847 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATF3P18847 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATF3P18847 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATF3P18847 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATF3P18847 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATF3P18847 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATF3P18847 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATF3P18847 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATF3P18847 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATF3P18847 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATF3P18847 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATF3P18847 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ATF3P18847 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATF3P18847 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATF3P18847 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATF3P18847 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATF3P18847 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATF3P18847 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ATF3P18847 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATF3P18847 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATF3P18847 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATF3P18847 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATF3P18847 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATF3P18847 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATF3P18847 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATF3P18847 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATF3P18847 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATF3P18847 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATF3P18847 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATF3P18847 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATF3P18847 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATF3P18847 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF3P18847 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF3P18847 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF3P18847 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF3P18847 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF3P18847 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF3P18847 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF3P18847 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF3P18847 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF3P18847 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF3P18847 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF3P18847 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF3P18847 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF3P18847 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF3P18847 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF3P18847 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF3P18847 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF3P18847 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF3P18847 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF3P18847 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF3P18847 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF3P18847 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF3P18847 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF3P18847 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF3P18847 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF3P18847 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF3P18847 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF3P18847 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF3P18847 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF3P18847 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF3P18847 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF3P18847 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF3P18847 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF3P18847 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF3P18847 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF3P18847 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF3P18847 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF3P18847 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF3P18847 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF3P18847 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms