Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL2P13500 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL2P13500 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL2P13500 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL2P13500 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL2P13500 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL2P13500 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL2P13500 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL2P13500 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL2P13500 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL2P13500 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL2P13500 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL2P13500 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL2P13500 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL2P13500 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL2P13500 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL2P13500 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL2P13500 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL2P13500 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL2P13500 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL2P13500 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL2P13500 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL2P13500 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL2P13500 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL2P13500 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL2P13500 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL2P13500 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL2P13500 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL2P13500 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL2P13500 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL2P13500 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL2P13500 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL2P13500 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL2P13500 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCL2P13500 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CCL2P13500 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCL2P13500 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCL2P13500 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCL2P13500 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCL2P13500 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CCL2P13500 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCL2P13500 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCL2P13500 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCL2P13500 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCL2P13500 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCL2P13500 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCL2P13500 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCL2P13500 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CCL2P13500 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CCL2P13500 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CCL2P13500 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
CCL2P13500 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCL2P13500 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCL2P13500 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCL2P13500 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCL2P13500 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCL2P13500 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCL2P13500 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCL2P13500 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCL2P13500 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCL2P13500 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCL2P13500 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCL2P13500 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCL2P13500 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCL2P13500 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCL2P13500 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCL2P13500 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCL2P13500 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCL2P13500 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL2P13500 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL2P13500 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL2P13500 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL2P13500 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL2P13500 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL2P13500 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL2P13500 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL2P13500 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL2P13500 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL2P13500 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL2P13500 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL2P13500 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL2P13500 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL2P13500 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL2P13500 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL2P13500 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL2P13500 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL2P13500 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL2P13500 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL2P13500 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL2P13500 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL2P13500 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL2P13500 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL2P13500 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL2P13500 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL2P13500 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL2P13500 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL2P13500 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL2P13500 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL2P13500 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL2P13500 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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