Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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