Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms