Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3P10147 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3P10147 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3P10147 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3P10147 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3P10147 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3P10147 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3P10147 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3P10147 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3P10147 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3P10147 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3P10147 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3P10147 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3P10147 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3P10147 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3P10147 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3P10147 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3P10147 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3P10147 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3P10147 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3P10147 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3P10147 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3P10147 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3P10147 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3P10147 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3P10147 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3P10147 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3P10147 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3P10147 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3P10147 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3P10147 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3P10147 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3P10147 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3P10147 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3P10147 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3P10147 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3P10147 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3P10147 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3P10147 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3P10147 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3P10147 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3P10147 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3P10147 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3P10147 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3P10147 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3P10147 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3P10147 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3P10147 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3P10147 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3P10147 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3P10147 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3P10147 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3P10147 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3P10147 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3P10147 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3P10147 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3P10147 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3P10147 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3P10147 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3P10147 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3P10147 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3P10147 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3P10147 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3P10147 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3P10147 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3P10147 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3P10147 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3P10147 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3P10147 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3P10147 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3P10147 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3P10147 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3P10147 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3P10147 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3P10147 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3P10147 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3P10147 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3P10147 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3P10147 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3P10147 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3P10147 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3P10147 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3P10147 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3P10147 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3P10147 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3P10147 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3P10147 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3P10147 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3P10147 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3P10147 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3P10147 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3P10147 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3P10147 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3P10147 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3P10147 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL3P10147 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL3P10147 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL3P10147 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL3P10147 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL3P10147 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms