Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms