Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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