Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSP90AB1P08238 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms