Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFLP07196 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFLP07196 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFLP07196 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFLP07196 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFLP07196 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFLP07196 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFLP07196 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFLP07196 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFLP07196 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFLP07196 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFLP07196 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFLP07196 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFLP07196 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFLP07196 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFLP07196 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFLP07196 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFLP07196 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFLP07196 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFLP07196 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFLP07196 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFLP07196 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFLP07196 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFLP07196 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFLP07196 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFLP07196 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFLP07196 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEFLP07196 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEFLP07196 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEFLP07196 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEFLP07196 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEFLP07196 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEFLP07196 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEFLP07196 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEFLP07196 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEFLP07196 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEFLP07196 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEFLP07196 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEFLP07196 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEFLP07196 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEFLP07196 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEFLP07196 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEFLP07196 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEFLP07196 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEFLP07196 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEFLP07196 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEFLP07196 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEFLP07196 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEFLP07196 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEFLP07196 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEFLP07196 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFLP07196 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFLP07196 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFLP07196 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFLP07196 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFLP07196 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFLP07196 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFLP07196 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFLP07196 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFLP07196 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFLP07196 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFLP07196 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFLP07196 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFLP07196 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFLP07196 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFLP07196 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFLP07196 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFLP07196 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFLP07196 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFLP07196 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFLP07196 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFLP07196 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFLP07196 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFLP07196 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEFLP07196 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEFLP07196 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEFLP07196 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEFLP07196 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEFLP07196 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEFLP07196 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEFLP07196 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEFLP07196 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEFLP07196 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEFLP07196 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEFLP07196 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEFLP07196 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEFLP07196 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEFLP07196 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEFLP07196 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEFLP07196 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEFLP07196 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEFLP07196 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEFLP07196 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEFLP07196 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEFLP07196 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEFLP07196 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEFLP07196 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEFLP07196 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEFLP07196 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEFLP07196 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms