Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms