Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRATO95237 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LRATO95237 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRATO95237 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRATO95237 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRATO95237 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRATO95237 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRATO95237 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRATO95237 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRATO95237 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRATO95237 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRATO95237 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRATO95237 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRATO95237 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRATO95237 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRATO95237 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRATO95237 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LRATO95237 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LRATO95237 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRATO95237 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRATO95237 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRATO95237 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRATO95237 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRATO95237 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRATO95237 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRATO95237 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRATO95237 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRATO95237 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRATO95237 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRATO95237 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRATO95237 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRATO95237 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRATO95237 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRATO95237 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRATO95237 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRATO95237 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LRATO95237 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRATO95237 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRATO95237 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LRATO95237 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRATO95237 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LRATO95237 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRATO95237 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRATO95237 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRATO95237 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRATO95237 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRATO95237 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRATO95237 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRATO95237 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRATO95237 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRATO95237 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LRATO95237 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRATO95237 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRATO95237 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRATO95237 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRATO95237 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LRATO95237 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRATO95237 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRATO95237 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRATO95237 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRATO95237 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRATO95237 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRATO95237 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRATO95237 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRATO95237 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRATO95237 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRATO95237 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRATO95237 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRATO95237 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRATO95237 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRATO95237 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRATO95237 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRATO95237 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRATO95237 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRATO95237 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRATO95237 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRATO95237 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRATO95237 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRATO95237 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LRATO95237 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRATO95237 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRATO95237 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRATO95237 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRATO95237 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRATO95237 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRATO95237 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRATO95237 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRATO95237 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRATO95237 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRATO95237 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRATO95237 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRATO95237 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRATO95237 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRATO95237 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRATO95237 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRATO95237 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRATO95237 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRATO95237 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRATO95237 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LRATO95237 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms