Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNSO60931 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNSO60931 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNSO60931 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNSO60931 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNSO60931 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNSO60931 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNSO60931 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNSO60931 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNSO60931 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNSO60931 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNSO60931 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNSO60931 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNSO60931 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNSO60931 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNSO60931 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNSO60931 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNSO60931 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNSO60931 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNSO60931 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNSO60931 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNSO60931 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNSO60931 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNSO60931 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNSO60931 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNSO60931 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNSO60931 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNSO60931 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNSO60931 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNSO60931 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNSO60931 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNSO60931 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNSO60931 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNSO60931 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNSO60931 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNSO60931 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNSO60931 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNSO60931 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNSO60931 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNSO60931 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNSO60931 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNSO60931 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNSO60931 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNSO60931 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNSO60931 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNSO60931 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNSO60931 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNSO60931 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNSO60931 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNSO60931 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNSO60931 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNSO60931 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNSO60931 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNSO60931 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNSO60931 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNSO60931 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNSO60931 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNSO60931 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNSO60931 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNSO60931 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNSO60931 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNSO60931 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNSO60931 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNSO60931 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNSO60931 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNSO60931 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNSO60931 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNSO60931 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNSO60931 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNSO60931 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNSO60931 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNSO60931 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNSO60931 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNSO60931 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNSO60931 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNSO60931 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNSO60931 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNSO60931 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNSO60931 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNSO60931 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNSO60931 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTNSO60931 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTNSO60931 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTNSO60931 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTNSO60931 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTNSO60931 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTNSO60931 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTNSO60931 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNSO60931 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNSO60931 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNSO60931 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNSO60931 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNSO60931 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNSO60931 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNSO60931 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNSO60931 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNSO60931 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNSO60931 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNSO60931 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNSO60931 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms