Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PPLO60437 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPLO60437 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPLO60437 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPLO60437 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPLO60437 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPLO60437 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPLO60437 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPLO60437 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPLO60437 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPLO60437 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PPLO60437 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPLO60437 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPLO60437 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPLO60437 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PPLO60437 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPLO60437 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PPLO60437 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PPLO60437 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PPLO60437 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PPLO60437 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPLO60437 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPLO60437 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPLO60437 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PPLO60437 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPLO60437 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPLO60437 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPLO60437 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPLO60437 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPLO60437 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPLO60437 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PPLO60437 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PPLO60437 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPLO60437 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPLO60437 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPLO60437 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPLO60437 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPLO60437 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPLO60437 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPLO60437 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPLO60437 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPLO60437 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPLO60437 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPLO60437 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPLO60437 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPLO60437 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPLO60437 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PPLO60437 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PPLO60437 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPLO60437 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPLO60437 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPLO60437 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPLO60437 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPLO60437 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPLO60437 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPLO60437 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPLO60437 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPLO60437 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPLO60437 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPLO60437 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPLO60437 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPLO60437 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPLO60437 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PPLO60437 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPLO60437 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPLO60437 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPLO60437 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPLO60437 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPLO60437 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPLO60437 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPLO60437 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPLO60437 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PPLO60437 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPLO60437 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPLO60437 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPLO60437 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPLO60437 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PPLO60437 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPLO60437 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PPLO60437 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPLO60437 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPLO60437 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPLO60437 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPLO60437 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPLO60437 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPLO60437 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPLO60437 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPLO60437 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPLO60437 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPLO60437 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPLO60437 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPLO60437 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPLO60437 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPLO60437 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPLO60437 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPLO60437 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPLO60437 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPLO60437 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPLO60437 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPLO60437 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms