Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYNGR2O43760 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms