Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRODHO43272 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRODHO43272 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRODHO43272 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRODHO43272 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRODHO43272 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRODHO43272 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRODHO43272 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRODHO43272 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRODHO43272 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRODHO43272 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRODHO43272 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRODHO43272 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRODHO43272 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRODHO43272 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRODHO43272 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PRODHO43272 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRODHO43272 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRODHO43272 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRODHO43272 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRODHO43272 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRODHO43272 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRODHO43272 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRODHO43272 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRODHO43272 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRODHO43272 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRODHO43272 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRODHO43272 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PRODHO43272 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRODHO43272 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRODHO43272 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRODHO43272 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRODHO43272 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PRODHO43272 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRODHO43272 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRODHO43272 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRODHO43272 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRODHO43272 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRODHO43272 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRODHO43272 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRODHO43272 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PRODHO43272 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRODHO43272 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRODHO43272 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRODHO43272 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRODHO43272 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRODHO43272 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRODHO43272 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRODHO43272 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRODHO43272 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRODHO43272 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRODHO43272 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRODHO43272 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRODHO43272 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRODHO43272 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRODHO43272 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRODHO43272 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRODHO43272 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRODHO43272 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRODHO43272 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRODHO43272 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRODHO43272 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRODHO43272 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRODHO43272 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRODHO43272 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRODHO43272 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRODHO43272 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRODHO43272 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRODHO43272 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRODHO43272 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRODHO43272 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRODHO43272 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRODHO43272 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRODHO43272 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRODHO43272 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRODHO43272 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRODHO43272 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRODHO43272 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRODHO43272 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRODHO43272 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRODHO43272 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRODHO43272 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRODHO43272 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRODHO43272 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRODHO43272 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRODHO43272 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRODHO43272 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRODHO43272 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRODHO43272 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRODHO43272 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRODHO43272 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRODHO43272 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRODHO43272 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRODHO43272 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRODHO43272 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRODHO43272 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRODHO43272 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRODHO43272 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRODHO43272 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRODHO43272 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms