Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNMO15061 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNMO15061 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNMO15061 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNMO15061 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNMO15061 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNMO15061 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNMO15061 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNMO15061 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNMO15061 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNMO15061 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNMO15061 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNMO15061 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNMO15061 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNMO15061 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNMO15061 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNMO15061 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNMO15061 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNMO15061 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNMO15061 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNMO15061 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNMO15061 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNMO15061 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNMO15061 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNMO15061 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNMO15061 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNMO15061 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNMO15061 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNMO15061 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNMO15061 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNMO15061 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNMO15061 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNMO15061 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNMO15061 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNMO15061 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNMO15061 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNMO15061 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNMO15061 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNMO15061 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNMO15061 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNMO15061 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNMO15061 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNMO15061 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNMO15061 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNMO15061 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNMO15061 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNMO15061 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNMO15061 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNMO15061 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNMO15061 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNMO15061 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNMO15061 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNMO15061 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNMO15061 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNMO15061 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNMO15061 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNMO15061 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNMO15061 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNMO15061 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNMO15061 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNMO15061 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNMO15061 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNMO15061 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNMO15061 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNMO15061 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNMO15061 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNMO15061 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SYNMO15061 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SYNMO15061 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SYNMO15061 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SYNMO15061 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SYNMO15061 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SYNMO15061 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SYNMO15061 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNMO15061 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNMO15061 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNMO15061 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNMO15061 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNMO15061 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNMO15061 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNMO15061 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNMO15061 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNMO15061 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNMO15061 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNMO15061 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNMO15061 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNMO15061 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNMO15061 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNMO15061 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNMO15061 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNMO15061 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNMO15061 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNMO15061 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNMO15061 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNMO15061 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNMO15061 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNMO15061 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNMO15061 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNMO15061 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNMO15061 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms