Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms