Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLR3AO14802 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR3AO14802 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms