Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
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