Protein–RNA interactions for Protein: H3BNH8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNH8 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BNH8 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BNH8 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BNH8 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BNH8 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BNH8 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BNH8 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BNH8 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BNH8 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BNH8 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BNH8 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BNH8 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BNH8 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BNH8 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BNH8 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BNH8 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BNH8 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BNH8 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BNH8 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BNH8 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BNH8 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BNH8 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BNH8 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BNH8 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BNH8 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BNH8 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BNH8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BNH8 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BNH8 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BNH8 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BNH8 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BNH8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BNH8 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BNH8 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BNH8 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BNH8 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BNH8 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BNH8 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BNH8 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BNH8 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BNH8 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BNH8 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BNH8 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BNH8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BNH8 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BNH8 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BNH8 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BNH8 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BNH8 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BNH8 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BNH8 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BNH8 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BNH8 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BNH8 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BNH8 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BNH8 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BNH8 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BNH8 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BNH8 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BNH8 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BNH8 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BNH8 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BNH8 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BNH8 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BNH8 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BNH8 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BNH8 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BNH8 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BNH8 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BNH8 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BNH8 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BNH8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BNH8 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BNH8 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BNH8 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BNH8 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BNH8 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BNH8 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BNH8 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BNH8 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BNH8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BNH8 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BNH8 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BNH8 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BNH8 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BNH8 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BNH8 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BNH8 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3BNH8 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3BNH8 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3BNH8 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3BNH8 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3BNH8 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3BNH8 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3BNH8 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3BNH8 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3BNH8 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3BNH8 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3BNH8 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3BNH8 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms