Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms