Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms