Protein–RNA interactions for Protein: A6NJU9

NPIPB13, Nuclear pore complex-interacting protein family member B13, humanhuman

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Length 1,138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB13A6NJU9 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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NPIPB13A6NJU9 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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NPIPB13A6NJU9 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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NPIPB13A6NJU9 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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NPIPB13A6NJU9 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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NPIPB13A6NJU9 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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NPIPB13A6NJU9 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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