Protein–RNA interactions for Protein: A4D161

FAM221A, Protein FAM221A, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM221AA4D161 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM221AA4D161 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms