Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAD54BQ9Y620 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms