Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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USP18Q9UMW8 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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USP18Q9UMW8 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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