Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms