Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL19

RARRES3, Retinoic acid receptor responder protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES3Q9UL19 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RARRES3Q9UL19 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms