Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP25Q9UHP3 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP25Q9UHP3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
USP25Q9UHP3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP25Q9UHP3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP25Q9UHP3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP25Q9UHP3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP25Q9UHP3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP25Q9UHP3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP25Q9UHP3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP25Q9UHP3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP25Q9UHP3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP25Q9UHP3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP25Q9UHP3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
USP25Q9UHP3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP25Q9UHP3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP25Q9UHP3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP25Q9UHP3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP25Q9UHP3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
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