Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms