Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MIS18AQ9NYP9 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MIS18AQ9NYP9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MIS18AQ9NYP9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MIS18AQ9NYP9 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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MIS18AQ9NYP9 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
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