Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms