Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms