Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms