Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms