Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCC0

MCCC2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC2Q9HCC0 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms