Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms